Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FYCO1Q9BQS8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms