Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS8Q99627 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS8Q99627 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms