Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms