Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPS6KC1Q96S38 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms