Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC7Q96M83 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms