Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHDQ96IW2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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