Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGF29Q96ES7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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