Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms