Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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COPS9Q8WXC6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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COPS9Q8WXC6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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COPS9Q8WXC6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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COPS9Q8WXC6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
COPS9Q8WXC6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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