Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LRRC17Q8N6Y2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRC17Q8N6Y2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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LRRC17Q8N6Y2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC17Q8N6Y2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC17Q8N6Y2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC17Q8N6Y2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC17Q8N6Y2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRC17Q8N6Y2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRC17Q8N6Y2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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