Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD35Q8N283 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms