Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALYREFQ86V81 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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