Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
WDR53Q7Z5U6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms