Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms