Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CATSPER4Q7RTX7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms