Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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USP45Q70EL2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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USP45Q70EL2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP45Q70EL2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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