Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms