Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PRR27Q6MZM9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms