Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL2Q6F5E8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms