Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP9Q5VTM2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms