Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LDLRAP1Q5SW96 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms