Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms