Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 LMOD3-203ENST00000489031 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
C5orf47Q569G3 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms