Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFTN2Q52LD8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms