Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms