Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETM2Q2VYF4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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