Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT16Q17RD7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms