Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms