Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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