Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RTN1Q16799 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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