Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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