Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NEDD8Q15843 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8Q15843 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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