Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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