Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALX1Q15699 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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