Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYTH1Q15438 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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CYTH1Q15438 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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