Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PUM3Q15397 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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