Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB3GAP1Q15042 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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