Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPRHQ149N8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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