Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HNF4GQ14541 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms