Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL9A3Q14050 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL9A3Q14050 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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