Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
COTL1Q14019 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms