Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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