Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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CBX3Q13185 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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CBX3Q13185 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CBX3Q13185 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
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CBX3Q13185 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBX3Q13185 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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