Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXD4Q12950 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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