Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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GRIN2AQ12879 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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