Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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