Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB2Q08289 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNB2Q08289 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms