Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEUP1Q05D60 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms