Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms