Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NUCB1Q02818 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NUCB1Q02818 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms